Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clip2Q9Z0H8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Clip2Q9Z0H8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip2Q9Z0H8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clip2Q9Z0H8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms