Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ArcQ9WV31 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ArcQ9WV31 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
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ArcQ9WV31 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
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ArcQ9WV31 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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ArcQ9WV31 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ArcQ9WV31 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
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ArcQ9WV31 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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ArcQ9WV31 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
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ArcQ9WV31 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ArcQ9WV31 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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