Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb2Q9R1P3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb2Q9R1P3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms