Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PdcQ9QW08 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PdcQ9QW08 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms