Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM0

Itga2b, Integrin alpha-IIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga2bQ9QUM0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga2bQ9QUM0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga2bQ9QUM0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga2bQ9QUM0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga2bQ9QUM0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga2bQ9QUM0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga2bQ9QUM0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga2bQ9QUM0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga2bQ9QUM0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga2bQ9QUM0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga2bQ9QUM0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga2bQ9QUM0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga2bQ9QUM0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga2bQ9QUM0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga2bQ9QUM0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga2bQ9QUM0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga2bQ9QUM0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga2bQ9QUM0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga2bQ9QUM0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga2bQ9QUM0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga2bQ9QUM0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga2bQ9QUM0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga2bQ9QUM0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Itga2bQ9QUM0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga2bQ9QUM0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga2bQ9QUM0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga2bQ9QUM0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga2bQ9QUM0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga2bQ9QUM0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga2bQ9QUM0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms