Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx6Q9JKK1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx6Q9JKK1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Stx6Q9JKK1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx6Q9JKK1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Stx6Q9JKK1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stx6Q9JKK1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stx6Q9JKK1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stx6Q9JKK1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms