Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Copb1Q9JIF7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Copb1Q9JIF7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Copb1Q9JIF7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Copb1Q9JIF7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms