Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ube3bQ9ES34 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ube3bQ9ES34 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ube3bQ9ES34 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ube3bQ9ES34 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
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