Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ripk4Q9ERK0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ripk4Q9ERK0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ripk4Q9ERK0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms