Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csnk1dQ9DC28 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk1dQ9DC28 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csnk1dQ9DC28 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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