Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ap1s2Q9DB50 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ap1s2Q9DB50 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ap1s2Q9DB50 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ap1s2Q9DB50 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ap1s2Q9DB50 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ap1s2Q9DB50 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ap1s2Q9DB50 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ap1s2Q9DB50 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ap1s2Q9DB50 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ap1s2Q9DB50 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ap1s2Q9DB50 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ap1s2Q9DB50 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap1s2Q9DB50 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap1s2Q9DB50 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap1s2Q9DB50 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms