Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc39Q9D5Y1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms