Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lonrf3Q9D4H7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lonrf3Q9D4H7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lonrf3Q9D4H7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms