Protein–RNA interactions for Protein: Q9D496

4930548H24Rik, RIKEN cDNA 4930548H24, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930548H24RikQ9D496 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930548H24RikQ9D496 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
4930548H24RikQ9D496 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930548H24RikQ9D496 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930548H24RikQ9D496 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930548H24RikQ9D496 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930548H24RikQ9D496 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
4930548H24RikQ9D496 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
4930548H24RikQ9D496 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930548H24RikQ9D496 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930548H24RikQ9D496 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms