Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pramef12Q9D2F1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pramef12Q9D2F1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pramef12Q9D2F1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramef12Q9D2F1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239.5 ms