Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9CYI0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9CYI0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9CYI0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9CYI0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q9CYI0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q9CYI0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9CYI0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9CYI0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9CYI0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9CYI0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q9CYI0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9CYI0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9CYI0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9CYI0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9CYI0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9CYI0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms