Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem39aQ9CYC3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmem39aQ9CYC3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem39aQ9CYC3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms