Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf1Q9CWX2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf1Q9CWX2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf1Q9CWX2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf1Q9CWX2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf1Q9CWX2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf1Q9CWX2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf1Q9CWX2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf1Q9CWX2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf1Q9CWX2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufaf1Q9CWX2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufaf1Q9CWX2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufaf1Q9CWX2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufaf1Q9CWX2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufaf1Q9CWX2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ndufaf1Q9CWX2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufaf1Q9CWX2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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