Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smyd3Q9CWR2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smyd3Q9CWR2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms