Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BccipQ9CWI3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.56
BccipQ9CWI3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms