Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chmp3Q9CQ10 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Chmp3Q9CQ10 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chmp3Q9CQ10 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
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