Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ms4a8Q99N10 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a8Q99N10 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a8Q99N10 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a8Q99N10 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a8Q99N10 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a8Q99N10 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Ms4a8Q99N10 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a8Q99N10 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a8Q99N10 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a8Q99N10 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a8Q99N10 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a8Q99N10 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Ms4a8Q99N10 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Ms4a8Q99N10 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Ms4a8Q99N10 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Ms4a8Q99N10 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a8Q99N10 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Ms4a8Q99N10 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Ms4a8Q99N10 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a8Q99N10 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ms4a8Q99N10 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ms4a8Q99N10 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Ms4a8Q99N10 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Ms4a8Q99N10 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a8Q99N10 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a8Q99N10 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a8Q99N10 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ms4a8Q99N10 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Ms4a8Q99N10 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Ms4a8Q99N10 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a8Q99N10 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a8Q99N10 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a8Q99N10 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a8Q99N10 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a8Q99N10 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a8Q99N10 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a8Q99N10 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a8Q99N10 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a8Q99N10 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a8Q99N10 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a8Q99N10 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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