Protein–RNA interactions for Protein: Q924W6

Trim66, Tripartite motif-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim66Q924W6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim66Q924W6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim66Q924W6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim66Q924W6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim66Q924W6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim66Q924W6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim66Q924W6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim66Q924W6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim66Q924W6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim66Q924W6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim66Q924W6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim66Q924W6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim66Q924W6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim66Q924W6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim66Q924W6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim66Q924W6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim66Q924W6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim66Q924W6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim66Q924W6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim66Q924W6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim66Q924W6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim66Q924W6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim66Q924W6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim66Q924W6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms