Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smc1bQ920F6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smc1bQ920F6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smc1bQ920F6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms