Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBX6

Mpdz, Multiple PDZ domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MpdzQ8VBX6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MpdzQ8VBX6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MpdzQ8VBX6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MpdzQ8VBX6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MpdzQ8VBX6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MpdzQ8VBX6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MpdzQ8VBX6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MpdzQ8VBX6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MpdzQ8VBX6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MpdzQ8VBX6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MpdzQ8VBX6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MpdzQ8VBX6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MpdzQ8VBX6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MpdzQ8VBX6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MpdzQ8VBX6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MpdzQ8VBX6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MpdzQ8VBX6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MpdzQ8VBX6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MpdzQ8VBX6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MpdzQ8VBX6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms