Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm9955Q8CEJ8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm9955Q8CEJ8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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