Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup88Q8CEC0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup88Q8CEC0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup88Q8CEC0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nup88Q8CEC0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms