Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8C1R3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8C1R3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8C1R3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8C1R3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8C1R3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8C1R3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8C1R3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C1R3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C1R3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C1R3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C1R3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C1R3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C1R3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C1R3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8C1R3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms