Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ5

Dclk3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk3Q8BWQ5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk3Q8BWQ5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dclk3Q8BWQ5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dclk3Q8BWQ5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Dclk3Q8BWQ5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dclk3Q8BWQ5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclk3Q8BWQ5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclk3Q8BWQ5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclk3Q8BWQ5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclk3Q8BWQ5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclk3Q8BWQ5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclk3Q8BWQ5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dclk3Q8BWQ5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dclk3Q8BWQ5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dclk3Q8BWQ5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dclk3Q8BWQ5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dclk3Q8BWQ5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dclk3Q8BWQ5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dclk3Q8BWQ5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dclk3Q8BWQ5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms