Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smad3Q8BUN5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smad3Q8BUN5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad3Q8BUN5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smad3Q8BUN5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms