Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup93Q8BJ71 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup93Q8BJ71 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup93Q8BJ71 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup93Q8BJ71 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup93Q8BJ71 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup93Q8BJ71 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup93Q8BJ71 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms