Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf8Q80TJ7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf8Q80TJ7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Phf8Q80TJ7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phf8Q80TJ7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phf8Q80TJ7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms