Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LnpkQ7TQ95 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LnpkQ7TQ95 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LnpkQ7TQ95 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms