Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hmgb4Q6P8W9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmgb4Q6P8W9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hmgb4Q6P8W9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmgb4Q6P8W9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms