Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PrimpolQ6P1E7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PrimpolQ6P1E7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrimpolQ6P1E7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms