Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
2810408A11RikQ6NSU2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms