Protein–RNA interactions for Protein: Q62432

Smad2, Mothers against decapentaplegic homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad2Q62432 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad2Q62432 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad2Q62432 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad2Q62432 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad2Q62432 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad2Q62432 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad2Q62432 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad2Q62432 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad2Q62432 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad2Q62432 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad2Q62432 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smad2Q62432 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad2Q62432 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smad2Q62432 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smad2Q62432 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad2Q62432 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad2Q62432 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad2Q62432 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad2Q62432 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad2Q62432 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad2Q62432 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad2Q62432 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad2Q62432 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms