Protein–RNA interactions for Protein: Q60771

Cldn11, Claudin-11, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11Q60771 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cldn11Q60771 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn11Q60771 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn11Q60771 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms