Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc125Q5U465 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc125Q5U465 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc125Q5U465 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.5 ms