Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sco1Q5SUC9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sco1Q5SUC9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sco1Q5SUC9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sco1Q5SUC9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Sco1Q5SUC9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sco1Q5SUC9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sco1Q5SUC9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sco1Q5SUC9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sco1Q5SUC9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sco1Q5SUC9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sco1Q5SUC9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sco1Q5SUC9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sco1Q5SUC9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sco1Q5SUC9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sco1Q5SUC9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sco1Q5SUC9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sco1Q5SUC9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms