Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Afg1lQ3V384 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Afg1lQ3V384 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms