Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
4933416C03RikQ3V063 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
4933416C03RikQ3V063 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
4933416C03RikQ3V063 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms