Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mindy4Q3UQI9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mindy4Q3UQI9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mindy4Q3UQI9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mindy4Q3UQI9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms