Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Cln5Q3UMW8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln5Q3UMW8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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Cln5Q3UMW8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Cln5Q3UMW8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cln5Q3UMW8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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Cln5Q3UMW8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms