Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ceacam5Q3UKK2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ceacam5Q3UKK2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ceacam5Q3UKK2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ceacam5Q3UKK2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ceacam5Q3UKK2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ceacam5Q3UKK2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ceacam5Q3UKK2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ceacam5Q3UKK2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ceacam5Q3UKK2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ceacam5Q3UKK2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ceacam5Q3UKK2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ceacam5Q3UKK2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ceacam5Q3UKK2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ceacam5Q3UKK2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ceacam5Q3UKK2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ceacam5Q3UKK2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ceacam5Q3UKK2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ceacam5Q3UKK2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ceacam5Q3UKK2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms