Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHN9

Ndst1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst1Q3UHN9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ndst1Q3UHN9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndst1Q3UHN9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndst1Q3UHN9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms