Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hace1Q3U0D9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hace1Q3U0D9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hace1Q3U0D9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hace1Q3U0D9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms