Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trmt1Q3TX08 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt1Q3TX08 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt1Q3TX08 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trmt1Q3TX08 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt1Q3TX08 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms