Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm1123Q1RME4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm1123Q1RME4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm1123Q1RME4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm1123Q1RME4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm1123Q1RME4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm1123Q1RME4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm1123Q1RME4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm1123Q1RME4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms