Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atf4Q06507 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atf4Q06507 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms